More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4199 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
316 aa  597  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  62.37 
 
 
314 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  60.63 
 
 
314 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  63.99 
 
 
318 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  55.21 
 
 
314 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  44.49 
 
 
326 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  41.16 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.8 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.94 
 
 
311 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.55 
 
 
311 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.46 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.52 
 
 
313 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.58 
 
 
328 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  41.32 
 
 
354 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.15 
 
 
325 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.35 
 
 
366 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  36.5 
 
 
819 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.99 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.79 
 
 
336 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  36.44 
 
 
335 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.16 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.31 
 
 
354 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  36.98 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.8 
 
 
310 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  39.63 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  38.06 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.93 
 
 
689 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  39.34 
 
 
391 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  36.44 
 
 
1094 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  37.91 
 
 
580 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  34.72 
 
 
1667 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.6 
 
 
366 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  40 
 
 
810 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  36.4 
 
 
479 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.16 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.12 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.21 
 
 
752 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.05 
 
 
457 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.5 
 
 
451 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.91 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  34.11 
 
 
556 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  33.46 
 
 
332 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.7 
 
 
607 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.42 
 
 
365 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.74 
 
 
366 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  33.65 
 
 
776 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.46 
 
 
971 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 
517 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.42 
 
 
652 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.76 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.14 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.02 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.04 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.04 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.04 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.34 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  29.97 
 
 
387 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46.21 
 
 
154 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.13 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  32.26 
 
 
487 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.1 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.28 
 
 
377 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  32.14 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.07 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.93 
 
 
1170 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.92 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.97 
 
 
821 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.39 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  32.83 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.6 
 
 
327 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.7 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.03 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.03 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.03 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.56 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.18 
 
 
488 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.52 
 
 
332 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.43 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.6 
 
 
384 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.49 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.17 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.06 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.35 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.55 
 
 
1189 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.05 
 
 
660 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.88 
 
 
829 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.14 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.48 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.96 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  43.86 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.58 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.77 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  32.12 
 
 
408 aa  79.3  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.33 
 
 
479 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.41 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  36.13 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.08 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.76 
 
 
1067 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.16 
 
 
974 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>