53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1422 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 276 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  53.45 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.09 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  33.57 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  32.32 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.19 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  36.43 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  35.53 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  33.8 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  33.58 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  34.81 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  48.94 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.69 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  43.17 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  45.93 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.68 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.21 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  40.94 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  32.55 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  44.27 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  34.41 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  42.96 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  42.96 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  42.96 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  42.96 
 
 		 383 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  42.96 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  42.96 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  42.96 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  31.86 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  41.04 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  41.04 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  40.58 
 
 		 322 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  42.42 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.87 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  28.3 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  26.85 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  27.53 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  27.53 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  26.98 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  25.25 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  45.76 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  45 
 
 		 495 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  45.76 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  45.76 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  45.76 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  24.22 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  23.99 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  31.22 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.03 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23.45 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  27.45 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  25.71 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>