195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1304 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1304  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  788    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  65.74 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  31.55 
 
 		 466 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.76 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  29.02 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.5 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  29.04 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  28.04 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.27 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.34 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  25.67 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  25.67 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  25.67 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  25.67 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  25.67 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  28.17 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  26.29 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  26.29 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  26.42 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  29.81 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  31.67 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.27 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  30.26 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.27 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  28.66 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  28.8 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2601  hypothetical protein  28.34 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0722822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  27.95 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  30.26 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  23.38 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  36.19 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  29.28 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>