More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0771 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  64.41 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  54.24 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  51.06 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.22 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.6 
 
 		 256 aa  215  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3781  two component transcriptional regulator  48.73 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.2 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  49.79 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  54.36 
 
 		 270 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  51.93 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.93 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  49.38 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.23 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  50.84 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.63 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  46.89 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.97 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 240 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.71 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.52 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 248 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  48.09 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.64 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  45.57 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  46.19 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.26 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  45.76 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  46.25 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  47.03 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  47.03 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  45.11 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.25 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.84 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  45.97 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  45.68 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  47.03 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.92 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>