260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4492 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 267 aa  517  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  83.65 
 
 		 266 aa  407  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  81.89 
 
 		 266 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  60.56 
 
 		 281 aa  301  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  54.47 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  57.31 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  51.23 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  36.05 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  41.22 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  28.16 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  25.22 
 
 		 437 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  32.27 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  24.41 
 
 		 439 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  21.33 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  24.06 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  26.64 
 
 		 505 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.68 
 
 		 364 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  23.47 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  34.29 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.79 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  35.51 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.2 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.99 
 
 		 311 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  35.04 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  22.39 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.63 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.25 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  28.35 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  27.24 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.56 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  30.1 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  34.53 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  28.85 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.67 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  36.03 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  27.04 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.73 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.86 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  33.76 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.44 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  30.37 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.61 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  27.31 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  33.5 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  27.34 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  30 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.47 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  28.81 
 
 		 375 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.27 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  30.49 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.75 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.37 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  25.41 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  30.21 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  32.14 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  27.95 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.94 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.79 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.79 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.58 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  34.29 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  39.23 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.57 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.37 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.94 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  34.53 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2807  Prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  27.4 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  29.32 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  30.19 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>