More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4077 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 443 aa  859    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  78.13 
 
 		 444 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 442 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  43.54 
 
 		 276 aa  213  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.71 
 
 		 391 aa  199  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  39.74 
 
 		 467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  37.95 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 434 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  36.94 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.21 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 473 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 446 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  38.37 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  41.18 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  38.14 
 
 		 344 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 717 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  40.23 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  39.03 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  38.29 
 
 		 425 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 469 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  38.71 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  31.65 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  40.77 
 
 		 270 aa  173  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  41.41 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  37.11 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  44.21 
 
 		 358 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  39.29 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  33.74 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  30.5 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  33.95 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  29.66 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 454 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  36.92 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 488 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 442 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  31.82 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  37.32 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  31.49 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04427  two-component system sensor protein  44.19 
 
 		 219 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  35.49 
 
 		 458 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>