More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2284 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
427 aa  856    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  96.25 
 
 
427 aa  830    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  77.93 
 
 
431 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  96.25 
 
 
427 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  75.18 
 
 
437 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  75.66 
 
 
433 aa  617  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  72.6 
 
 
430 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  48.11 
 
 
435 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  49.38 
 
 
457 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  51.61 
 
 
426 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  44.99 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  47.62 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  45.61 
 
 
462 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  45.86 
 
 
456 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  45.11 
 
 
462 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  44.5 
 
 
477 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  45.64 
 
 
464 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  45.16 
 
 
464 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  42.53 
 
 
451 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  43.56 
 
 
454 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  44.97 
 
 
412 aa  318  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  43.07 
 
 
437 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  40.28 
 
 
447 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  39.72 
 
 
457 aa  292  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  42.36 
 
 
437 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  42.33 
 
 
435 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  41.83 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  41.83 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  38.06 
 
 
444 aa  269  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  38.78 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  35 
 
 
439 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  36.21 
 
 
460 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  31.81 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  33.01 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  33.01 
 
 
435 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  32.33 
 
 
444 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  33.57 
 
 
438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  37.5 
 
 
467 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  34.86 
 
 
460 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  30.18 
 
 
434 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  29.92 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.91 
 
 
429 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  32.55 
 
 
451 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  30.65 
 
 
448 aa  187  4e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.03 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  26.67 
 
 
451 aa  182  7e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  30.51 
 
 
447 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  30.02 
 
 
450 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  29.76 
 
 
450 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  29.2 
 
 
454 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  29.81 
 
 
436 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  30.27 
 
 
481 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  32.29 
 
 
448 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.9 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  31.96 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  30.77 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  30.68 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  31.3 
 
 
495 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.74 
 
 
451 aa  172  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  32.6 
 
 
453 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  29.63 
 
 
495 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  29.38 
 
 
439 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  29.38 
 
 
439 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  29.83 
 
 
453 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.38 
 
 
495 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  29.92 
 
 
495 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  30.08 
 
 
479 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  29 
 
 
446 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  27.99 
 
 
479 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  30.86 
 
 
471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.58 
 
 
496 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  33.08 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  28.92 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  28.74 
 
 
474 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  28.85 
 
 
497 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  31.82 
 
 
448 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  29.51 
 
 
494 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  29.56 
 
 
496 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  30.6 
 
 
451 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  27.21 
 
 
476 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  28.5 
 
 
441 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  29.41 
 
 
449 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  29.47 
 
 
478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  28.71 
 
 
496 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  29.77 
 
 
486 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
494 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.62 
 
 
439 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  28.82 
 
 
496 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  27.05 
 
 
504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  27.74 
 
 
437 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  26.41 
 
 
443 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0405  peptidase M16-like  27.3 
 
 
427 aa  146  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  26.41 
 
 
443 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0365  processing peptidase  28.88 
 
 
424 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  24.01 
 
 
439 aa  144  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  27.32 
 
 
495 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  25.72 
 
 
515 aa  143  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  25.47 
 
 
528 aa  140  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  26.43 
 
 
954 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  28.89 
 
 
876 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>