87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2768 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  100 
 
 
407 aa  818    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 
418 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  35.99 
 
 
404 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 
409 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 
410 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  44.73 
 
 
387 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  42.68 
 
 
642 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
385 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  32.05 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  30.04 
 
 
389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  30.22 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
407 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
408 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  21.51 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
439 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  25.98 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.87 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
471 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
364 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
373 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  21.34 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
365 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
384 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3130  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
765 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  21.95 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  29.73 
 
 
399 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  21.68 
 
 
381 aa  47  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  24.07 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0811  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
355 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
364 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
366 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
1080 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.97 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  19.94 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 
382 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
387 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
355 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0982  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
519 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1760  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
349 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
371 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.32 
 
 
336 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
370 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
353 aa  43.1  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
415 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
383 aa  43.1  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>