More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0927 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0927  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component-like protein  100 
 
 
296 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2215  ABC transporter related  45.96 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2217  ABC transporter related  41.24 
 
 
277 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.294499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0925  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  39.29 
 
 
259 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  41.22 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.48 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.29 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.29 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  41.59 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  40.45 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.73 
 
 
267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.58 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
252 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
261 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  43.17 
 
 
256 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  41.78 
 
 
251 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  40.49 
 
 
304 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.54 
 
 
260 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  42.55 
 
 
260 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.39 
 
 
304 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  39.16 
 
 
286 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  41.8 
 
 
303 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.9 
 
 
283 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
263 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  38.41 
 
 
279 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  42.23 
 
 
293 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  40.27 
 
 
259 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  41.8 
 
 
303 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  41.8 
 
 
303 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 
254 aa  205  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  40.57 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  41.83 
 
 
293 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
261 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  40.64 
 
 
282 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  42.61 
 
 
259 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  42.92 
 
 
249 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
308 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  38.28 
 
 
267 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
267 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  42.52 
 
 
283 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.41 
 
 
306 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  37.55 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  43.61 
 
 
284 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 
281 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
252 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  41.11 
 
 
285 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  35.8 
 
 
258 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  38.7 
 
 
262 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  37.4 
 
 
262 aa  198  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  38.66 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  34.25 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  37.64 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  40.87 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  36.89 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  36 
 
 
254 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  41.3 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.59 
 
 
259 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.34 
 
 
274 aa  195  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  37.69 
 
 
272 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  40 
 
 
259 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.5 
 
 
264 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  38.19 
 
 
274 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
276 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  40.97 
 
 
257 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  38.05 
 
 
279 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  41.59 
 
 
259 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.9 
 
 
280 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  38.49 
 
 
258 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3789  ABC transporter related  38.79 
 
 
281 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.860108  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  38.8 
 
 
267 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  39.29 
 
 
278 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  38.4 
 
 
272 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  33.46 
 
 
254 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  35.56 
 
 
292 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  41.28 
 
 
257 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.15 
 
 
263 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  37.8 
 
 
265 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  37.8 
 
 
265 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
264 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  39.39 
 
 
255 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  38.25 
 
 
265 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
265 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 
281 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  43.19 
 
 
278 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  38.62 
 
 
245 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  40 
 
 
293 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  40.43 
 
 
256 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
265 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  39.84 
 
 
262 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.64 
 
 
285 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  40 
 
 
293 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  38.25 
 
 
265 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.64 
 
 
285 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>