More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2604 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2604  chorismate synthase  100 
 
 		 331 aa  663    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  69.21 
 
 		 328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  67.07 
 
 		 334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1029  chorismate synthase  60.79 
 
 		 335 aa  349  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  51.49 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  53.43 
 
 		 357 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  55.85 
 
 		 351 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  53.01 
 
 		 364 aa  338  9e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  52.11 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.86 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  51.83 
 
 		 371 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.71 
 
 		 365 aa  335  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  52.02 
 
 		 354 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  50.42 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  50.99 
 
 		 373 aa  331  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  50.72 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  50.87 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  50.14 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  50.87 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  51.55 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  50.42 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  50.58 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  50.58 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  50.58 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  50.99 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  52.02 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  50.58 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  50.87 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  51.75 
 
 		 358 aa  323  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  51.16 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  49.58 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  48.97 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  50 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  49.58 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  51.73 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  49.42 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  49.86 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  51.45 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  51.16 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  53.54 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  50 
 
 		 361 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  51.45 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  49.57 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  51.73 
 
 		 354 aa  317  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  49.15 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  49.58 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  48.84 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  49.13 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  49.71 
 
 		 365 aa  316  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  47.98 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  50.15 
 
 		 358 aa  315  9e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  50.57 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  50.72 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  51.15 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  49.42 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  50.87 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  49 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  44.9 
 
 		 377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  50.57 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  47.38 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  52.57 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  50.29 
 
 		 369 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  51.58 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  50.29 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  50.29 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  50.29 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  48.02 
 
 		 362 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  50.29 
 
 		 369 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  50.29 
 
 		 369 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  48.02 
 
 		 362 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  50.29 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  50.29 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  49.13 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  49.13 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  50.86 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  47.98 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  52.02 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  52.02 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  48.7 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  49.28 
 
 		 359 aa  309  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  49.86 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  48.41 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  49.71 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  50.58 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  51.73 
 
 		 393 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3275  chorismate synthase  51.71 
 
 		 367 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  51.73 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  51.73 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>