More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2224 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2224  ribonuclease III  100 
 
 		 160 aa  316  7.999999999999999e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0167185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1116  ribonuclease III  50.99 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0037  ribonuclease III  52.82 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1315  hypothetical protein  46.38 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0304  ribonuclease III  38.67 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.821127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1493  ribonuclease III  35.77 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000322958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0608  ribonuclease III  38.67 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.815667  normal  0.533927 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  27.66 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  35.25 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.88 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  35 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  34.64 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  27.14 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  35.25 
 
 		 228 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  35.71 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  34.75 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  28.28 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  34.46 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  31.79 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  31.62 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  28.28 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  31.33 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  31.16 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  33.1 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  27.63 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  33.09 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  33.09 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  28.37 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  27.54 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  30.99 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  32.12 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  33.33 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  28.17 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  30.99 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  28.46 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  34.03 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  34.21 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  30.77 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  33.09 
 
 		 246 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  33.1 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  33.1 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  31.58 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  28.78 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  30.14 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  31.88 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  31.88 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  36.13 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  31.3 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  35.04 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  29.01 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  30.71 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  36.42 
 
 		 232 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  32.06 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  28.47 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  30.32 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  28.57 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  30.99 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  30.83 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  30.83 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  28.57 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  30.83 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  29.79 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  33.59 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  33.59 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  33.33 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  30 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  28.47 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  30.72 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  27.27 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  33.33 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  33.59 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  33.59 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  33.59 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  34.04 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  33.59 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  27.59 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  32.41 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  33.59 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  25.35 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  34.07 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  33.99 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  31 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  25.9 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  27.08 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  37.12 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  32.23 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  32.23 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  28.26 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  32.06 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  29.41 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  26.09 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  37.12 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  29.41 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  34.15 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  28.38 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  26.24 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  36.36 
 
 		 385 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  34.69 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  32.23 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  32.06 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>