54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1820 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 
261 aa  510  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  52.7 
 
 
246 aa  235  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  49.36 
 
 
249 aa  217  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  40.5 
 
 
254 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  40.17 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  35.71 
 
 
245 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  35.86 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  38.62 
 
 
245 aa  151  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  39.92 
 
 
263 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  38.52 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  36.13 
 
 
235 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  34.43 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  35.59 
 
 
229 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  36.8 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  35.89 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  35.94 
 
 
326 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  34.98 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  34.5 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  36.44 
 
 
254 aa  116  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  38.46 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  35.97 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  32.42 
 
 
322 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  29.8 
 
 
244 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  33.73 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  33.05 
 
 
365 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  30.52 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  35.19 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  34.03 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  32.78 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  31.85 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  31.05 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  31.05 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  31.85 
 
 
329 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  28.92 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  33.48 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  27.82 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  29.34 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  30.4 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  34.07 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  29.67 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  32.81 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  33.99 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  28.9 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  32.44 
 
 
328 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  27.68 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  28.19 
 
 
388 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  28.32 
 
 
401 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  26.34 
 
 
434 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  28.86 
 
 
355 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  27.13 
 
 
440 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  29.02 
 
 
401 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  30.19 
 
 
388 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  28.32 
 
 
401 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  27.7 
 
 
388 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>