259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1793 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  74.04 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  72.34 
 
 		 235 aa  354  5.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  70.64 
 
 		 235 aa  340  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  65.96 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  65.96 
 
 		 234 aa  317  9e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  53.81 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  40.25 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  38.77 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  38.26 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  39.56 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  37.29 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  37.44 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  39.57 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  36.24 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  35.93 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  37 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  36.91 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  36.07 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  36.4 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  37.72 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  36.56 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  35.84 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  38.21 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  36.68 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  34.8 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  34.63 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  31.74 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  30.77 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.62 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  26.86 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  29.61 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  25.56 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  29.89 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  29.02 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  30.18 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  28.5 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  28 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  30.56 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  28.96 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  27.91 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  26.7 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  28.72 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  31.14 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  23.98 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  28 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  28.33 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  27.22 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  22.35 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  28.5 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  30 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  27.81 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  26.82 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  26.37 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  22.65 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  30.32 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  26.4 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  30.82 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  25.91 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  23.46 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  30.82 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  23.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  26.16 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  26.16 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  25.82 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  25.82 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  22.65 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  26.16 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  26.04 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  30.82 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  26.7 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11880  urease accessory protein ureG  31.54 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.405112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  28.72 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 		 306 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3080  urease accessory protein UreG  32.08 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0322849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  26.98 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  23.2 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  22.73 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2830  urease accessory protein UreG  30.3 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2803  urease accessory protein UreG  30.3 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2847  urease accessory protein UreG  30.3 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  26.73 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  27.13 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  24.29 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  30.14 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  23.86 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  27.66 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>