More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1251 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
386 aa  763    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  59.07 
 
 
390 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  51.03 
 
 
381 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  44.65 
 
 
430 aa  350  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  43.47 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  50.38 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  46.5 
 
 
402 aa  306  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  42 
 
 
396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  39.7 
 
 
408 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  40.7 
 
 
397 aa  291  9e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  40.36 
 
 
387 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  37.13 
 
 
410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  37.56 
 
 
407 aa  242  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  35.07 
 
 
413 aa  235  8e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  38.36 
 
 
393 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  36.34 
 
 
367 aa  205  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  32.91 
 
 
448 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  32.9 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.47 
 
 
400 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  29.53 
 
 
404 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  29.53 
 
 
404 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  29.43 
 
 
397 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  30.08 
 
 
402 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
405 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.05 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.15 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.68 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.85 
 
 
401 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.1 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  28.23 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
401 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.23 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.31 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 
400 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  28.18 
 
 
397 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.38 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
413 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.32 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  30.45 
 
 
397 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.47 
 
 
409 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  28.71 
 
 
397 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  29.46 
 
 
397 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  26.83 
 
 
403 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.61 
 
 
658 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.08 
 
 
402 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 
404 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
406 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  28.71 
 
 
412 aa  123  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  29.1 
 
 
397 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  28.43 
 
 
402 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.55 
 
 
385 aa  123  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.86 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.09 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  32.2 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.8 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  28.96 
 
 
397 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  28.86 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  26.86 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  28.47 
 
 
397 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.26 
 
 
407 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.19 
 
 
656 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  28.19 
 
 
411 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  28.75 
 
 
670 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  29.23 
 
 
663 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  28.85 
 
 
653 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  29.73 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  28.33 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  29.46 
 
 
651 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  31.81 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  28.1 
 
 
657 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  29.23 
 
 
663 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  26.2 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  28.02 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.27 
 
 
408 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  28.22 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.14 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  27.23 
 
 
644 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 
418 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
407 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  26.73 
 
 
397 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  41.1 
 
 
443 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  27.68 
 
 
661 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  27.99 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  27.5 
 
 
402 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
405 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.35 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  28.5 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>