More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0796 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  100 
 
 
286 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  50.18 
 
 
291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 
281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
261 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  48.97 
 
 
261 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  45.67 
 
 
289 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
280 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  42.69 
 
 
271 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  44.39 
 
 
260 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  45.31 
 
 
278 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  44.75 
 
 
278 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  47.03 
 
 
271 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  45.5 
 
 
276 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  41.44 
 
 
277 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  39.46 
 
 
272 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
294 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  42.75 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  47.59 
 
 
260 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  45.99 
 
 
257 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  49.1 
 
 
257 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  38.43 
 
 
273 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  50.3 
 
 
257 aa  175  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  45.45 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  45.45 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  45.45 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  45.45 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  52.13 
 
 
277 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  47.9 
 
 
257 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  45.86 
 
 
257 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
257 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  45.86 
 
 
257 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  45.86 
 
 
257 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  45.86 
 
 
257 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  45.86 
 
 
257 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  45.86 
 
 
257 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  42.63 
 
 
276 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  43.24 
 
 
278 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  45.86 
 
 
257 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
319 aa  168  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  44.9 
 
 
260 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
319 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 
262 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  44.75 
 
 
258 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  41.2 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  45.5 
 
 
276 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  45.97 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  42.23 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  40.8 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  37.27 
 
 
321 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  44.51 
 
 
255 aa  161  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  44.51 
 
 
260 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  44.75 
 
 
260 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  44.51 
 
 
260 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
314 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  39.06 
 
 
303 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
303 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
298 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  38.71 
 
 
265 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  46.45 
 
 
278 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
319 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
305 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  39.91 
 
 
319 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
305 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
286 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  41.9 
 
 
307 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  40.96 
 
 
269 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  38.32 
 
 
326 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  41.12 
 
 
343 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  40 
 
 
315 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
321 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
326 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  36.4 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
261 aa  152  7e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  43.46 
 
 
303 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  33.06 
 
 
289 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
327 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  36.4 
 
 
319 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  36.21 
 
 
329 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  40 
 
 
310 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 
300 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  41.15 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
310 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
314 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
358 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  38.5 
 
 
312 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
382 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 
315 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
310 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
323 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
318 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
325 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  41.81 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  39.91 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>