64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8634 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  43.68 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  43.68 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  43.16 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  41.1 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  42.13 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.71 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  40.74 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 244 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  37.77 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  39.91 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  41.51 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 		 349 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  44.76 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  38.92 
 
 		 248 aa  128  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  37.58 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  33.99 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  32.79 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  28.85 
 
 		 572 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  28.85 
 
 		 572 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 505 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  22.17 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.18 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.45 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  25.45 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  23.84 
 
 		 281 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1245 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  19.16 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  24.18 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1098  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.041078  normal  0.0345837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.44 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 590 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  24.34 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  24.34 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  24.34 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1168  extracellular solute-binding protein family 3  24.64 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  24.64 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  24.34 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  23.53 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  17.65 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  23.15 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29430  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  25 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6191  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  25.9 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0015  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05402  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  30.23 
 
 		 280 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 262 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>