More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0650 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 466 aa  919    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  58.92 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  62.69 
 
 		 482 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 472 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  61.68 
 
 		 475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  53.58 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  40.5 
 
 		 453 aa  336  5e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  40.59 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  39.82 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  40.65 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.82 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.37 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.1 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.81 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 457 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 		 438 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.36 
 
 		 438 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  36.52 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  36.52 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.52 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.52 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.52 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.52 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.52 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 473 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.59 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.59 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.59 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.59 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  37.36 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  38.66 
 
 		 430 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 465 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.73 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 444 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  37.53 
 
 		 439 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.97 
 
 		 460 aa  265  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.2 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.93 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 445 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 439 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 460 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 457 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 457 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 457 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 451 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.27 
 
 		 437 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.37 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  34.7 
 
 		 447 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.37 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  36.34 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  35.88 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  35.67 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  37.12 
 
 		 433 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  39.07 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>