More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0885 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  100 
 
 
357 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.43 
 
 
363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  62.05 
 
 
356 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  63.39 
 
 
361 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  62.64 
 
 
368 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  62.4 
 
 
363 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  59.94 
 
 
360 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  59.38 
 
 
360 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  54.57 
 
 
357 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.95 
 
 
359 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  51.25 
 
 
361 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.47 
 
 
378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  48.47 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  48.19 
 
 
393 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  48.12 
 
 
367 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  48.65 
 
 
371 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  47.35 
 
 
361 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
361 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  48.73 
 
 
353 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.98 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.98 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  46.72 
 
 
379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  48.91 
 
 
353 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  47.58 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  46.76 
 
 
357 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  46.69 
 
 
356 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  46.94 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  46.59 
 
 
369 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
386 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  47.31 
 
 
371 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.06 
 
 
368 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.7 
 
 
369 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  49.27 
 
 
366 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  46.98 
 
 
371 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  47.92 
 
 
365 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  47.77 
 
 
359 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  47.41 
 
 
386 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
371 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  46.6 
 
 
372 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 
372 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  48.61 
 
 
362 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  47.62 
 
 
357 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  49.31 
 
 
355 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  47.85 
 
 
372 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  46.9 
 
 
370 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  46.58 
 
 
371 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  47.85 
 
 
372 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
360 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  47.85 
 
 
372 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  46.58 
 
 
371 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49 
 
 
369 aa  329  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  45.65 
 
 
368 aa  329  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  47.01 
 
 
358 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  46.13 
 
 
357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  48.62 
 
 
360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  49.57 
 
 
402 aa  328  8e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.99 
 
 
356 aa  328  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  47.09 
 
 
356 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  48.59 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  46.24 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45.98 
 
 
353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.7 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.7 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  47.88 
 
 
364 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  45.58 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  48.41 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  46.32 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  45.25 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  48.41 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  45.1 
 
 
359 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  47.01 
 
 
362 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  45.12 
 
 
376 aa  326  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.43 
 
 
367 aa  325  6e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  48.48 
 
 
356 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.43 
 
 
367 aa  325  6e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  47.03 
 
 
373 aa  325  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.2 
 
 
370 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  48.2 
 
 
352 aa  325  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  44.05 
 
 
356 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
356 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  47.56 
 
 
333 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.3 
 
 
364 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  46.45 
 
 
363 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
361 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
356 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  46.4 
 
 
371 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  48.04 
 
 
355 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  46.45 
 
 
363 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  48.6 
 
 
359 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.48 
 
 
363 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  46.03 
 
 
384 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>