More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0881 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.85 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.43 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  38.3 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  39.82 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.3 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  39.02 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  37.92 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  39.51 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.59 
 
 		 336 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  34.46 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  36.28 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  33.43 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4325  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.67 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  37.05 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  34.95 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.55 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.45 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.56 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.45 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 342 aa  198  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.45 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.84 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  35.38 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.25 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.28 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  34.15 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.55 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.55 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.45 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.55 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.69 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.13 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.24 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.24 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  34.29 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.13 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  36.14 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  36.14 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  36.14 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.64 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  35.84 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  30.89 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  35.84 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  35.84 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2838  transcriptional regulator AscG  35.84 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.64 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.93 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.94 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.76 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.94 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.22 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1112  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0361448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.63 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.76 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.23 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  32.57 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.4 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.84 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  33.84 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>