More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3734 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.22 
 
 
459 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.34 
 
 
457 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.43 
 
 
453 aa  641    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.21 
 
 
463 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.8 
 
 
460 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.36 
 
 
468 aa  661    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.21 
 
 
463 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.12 
 
 
457 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.21 
 
 
463 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
473 aa  985    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.8 
 
 
460 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.57 
 
 
458 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.48 
 
 
489 aa  632  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.98 
 
 
460 aa  625  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.29 
 
 
456 aa  623  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.61 
 
 
486 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.36 
 
 
459 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.66 
 
 
456 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.59 
 
 
466 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.84 
 
 
450 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.36 
 
 
459 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.36 
 
 
484 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.66 
 
 
456 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.66 
 
 
456 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.66 
 
 
456 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.21 
 
 
453 aa  608  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.53 
 
 
466 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.09 
 
 
466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.45 
 
 
562 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.94 
 
 
449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.3 
 
 
431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.52 
 
 
586 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.63 
 
 
573 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.15 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
586 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
586 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.69 
 
 
691 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.15 
 
 
614 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.06 
 
 
586 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
586 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.02 
 
 
666 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.64 
 
 
628 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
586 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.28 
 
 
617 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.06 
 
 
586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.15 
 
 
606 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.06 
 
 
586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.87 
 
 
629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.72 
 
 
573 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.51 
 
 
630 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.56 
 
 
585 aa  571  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0500  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.18 
 
 
629 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0550  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.09 
 
 
622 aa  565  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2313  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.52 
 
 
647 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.17 
 
 
658 aa  568  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1708  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.79 
 
 
624 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.998594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.4 
 
 
630 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0365925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03871  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.53 
 
 
631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.53 
 
 
631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.05 
 
 
625 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.26 
 
 
627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4728  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.58 
 
 
628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4494  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0642711  normal  0.0188033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2430  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.52 
 
 
628 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.53 
 
 
655 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.58 
 
 
638 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4442  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.53 
 
 
631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000546852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4536  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.75 
 
 
631 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1931  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.85 
 
 
628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.87 
 
 
631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0347  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.31 
 
 
681 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4031  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.53 
 
 
631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0125326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0284  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.74 
 
 
647 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.48 
 
 
627 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03824  hypothetical protein  60.53 
 
 
631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4228  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.53 
 
 
631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4485  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.31 
 
 
631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5462  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.53 
 
 
631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.416651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4496  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.32 
 
 
561 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1610  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.66 
 
 
628 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.42 
 
 
624 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0455  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
681 aa  560  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000571171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.17 
 
 
626 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0948  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.87 
 
 
627 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.38 
 
 
629 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0216  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.19 
 
 
651 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3853  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
681 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.04 
 
 
626 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3325  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.61 
 
 
614 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.982769  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.87 
 
 
629 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0162  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.17 
 
 
625 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268503  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.87 
 
 
627 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4570  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.65 
 
 
631 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0133622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2370  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.26 
 
 
630 aa  558  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.21 
 
 
630 aa  560  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.85 
 
 
642 aa  558  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>