More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3306 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  51.99 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  52.96 
 
 		 312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  52.3 
 
 		 327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  52.98 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  50.16 
 
 		 313 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  51 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  51.31 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  50.65 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  50.49 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  50.98 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  50.67 
 
 		 355 aa  301  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  51.33 
 
 		 345 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  49.17 
 
 		 314 aa  301  9e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  50.83 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  49.83 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  51.16 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  51.97 
 
 		 312 aa  298  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  49.67 
 
 		 321 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  50.16 
 
 		 339 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  50.33 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  50 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  49.49 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  49.83 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  49.83 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  49.49 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  50.83 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  50.68 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  49.49 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  49.49 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  49.01 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  52.49 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  51.27 
 
 		 328 aa  289  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  50.34 
 
 		 306 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  50.34 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  50.34 
 
 		 304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  50.34 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  50.34 
 
 		 304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  50.34 
 
 		 304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 312 aa  288  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  50.34 
 
 		 304 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  50.67 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  49.01 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  49.84 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  51.16 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  50.17 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  50.83 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  49.66 
 
 		 304 aa  281  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  51.03 
 
 		 308 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  53.27 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  49.33 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  49.33 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  48.04 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  46.86 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  45.99 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  47.7 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  48.54 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  47.7 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  45.42 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.36 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  45 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  46.38 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  48.68 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  48.71 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  44.04 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  43.75 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  40.47 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  40.26 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  40.13 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.47 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  39.46 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.61 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.1 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.3 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.39 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  38.41 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.82 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  38.32 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  38.28 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.31 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.31 
 
 		 309 aa  198  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.42 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.66 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.81 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.83 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.8 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>