249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3278 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  100 
 
 		 256 aa  488  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  46.99 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  48.2 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  42.32 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  47.84 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  44.59 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  43.36 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  46.44 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.29 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.68 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  39.43 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  42.73 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  33.88 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  44.39 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  45.33 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  37.6 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  45.61 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1759  cobalamin synthase  46.82 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.43 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33030  cobalamin synthase  43.64 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.49 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.71 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.02 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.76 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.41 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.69 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.68 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.78 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.04 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.08 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  35.77 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.76 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  31.91 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.93 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.16 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  32.4 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.89 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.14 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  35.65 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  30.9 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.85 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.08 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.08 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.78 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.23 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.37 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.23 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.39 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.83 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.83 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.83 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.83 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.04 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.1 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.46 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.16 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.28 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.1 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.56 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  41.67 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.78 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.24 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.63 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.34 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  28.97 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  29.63 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.15 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.63 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  29.6 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  32 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.66 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.17 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.4 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  30.65 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.83 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  30.45 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.95 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  30.47 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  29.96 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.9 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  35.32 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>