More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0654 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0654  ISRSO8-transposase orfB protein  100 
 
 
71 aa  147  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00557481  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1130  ISRSO8-transposase orfB protein  100 
 
 
71 aa  147  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59317  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  98.41 
 
 
289 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  98.41 
 
 
289 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  92.06 
 
 
289 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2230  integrase catalytic subunit  86.89 
 
 
198 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.226944  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2722  integrase catalytic subunit  67.27 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  52.46 
 
 
296 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  52.46 
 
 
296 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  52.46 
 
 
296 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  52.46 
 
 
296 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1914  IS5 family transposase orfB  60 
 
 
76 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.346093  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  60 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  60 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  60 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  60 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  60 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  59.62 
 
 
274 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  59.62 
 
 
286 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  58.18 
 
 
286 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  52.46 
 
 
296 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  52.46 
 
 
296 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  55.56 
 
 
280 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  55.56 
 
 
280 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  55.56 
 
 
280 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  51.67 
 
 
275 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  64.15 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  61.4 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  64.15 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  64.15 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  64.15 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  51.67 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  64.15 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  64.15 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  64.15 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.7 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  55.56 
 
 
279 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  55.56 
 
 
279 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  55.56 
 
 
279 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3686  Integrase catalytic region  55.17 
 
 
296 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  0.0371116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  59.26 
 
 
252 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.7 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.7 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.7 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.7 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.7 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  56.6 
 
 
278 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  56.6 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  58.93 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  58.93 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  50 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16450  hypothetical protein  54.55 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  54.55 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  48.39 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  55.56 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  52.83 
 
 
271 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  53.7 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  55.56 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  55.56 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  45.9 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  52.73 
 
 
286 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  45.9 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  45.9 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  55.56 
 
 
294 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  55.56 
 
 
294 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  55.56 
 
 
294 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  55.56 
 
 
294 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  52.83 
 
 
271 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
280 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  55.56 
 
 
294 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1861  hypothetical protein  50.94 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
280 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  48.39 
 
 
379 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  49.15 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  48.39 
 
 
272 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>