46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0558 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  98.46 
 
 
324 aa  644    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  100 
 
 
324 aa  653    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  96.6 
 
 
324 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  80.86 
 
 
324 aa  542  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  63.19 
 
 
326 aa  426  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  42.82 
 
 
339 aa  272  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  42.07 
 
 
346 aa  264  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  42.73 
 
 
346 aa  259  6e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  39.26 
 
 
350 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  41.64 
 
 
338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  40.47 
 
 
338 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  40.46 
 
 
351 aa  243  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  38.08 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  39.19 
 
 
346 aa  242  5e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  38.46 
 
 
333 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  38.04 
 
 
349 aa  236  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  39.65 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  38.85 
 
 
333 aa  229  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  38.05 
 
 
333 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  38.73 
 
 
333 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  39.05 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  36.07 
 
 
336 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  39.8 
 
 
300 aa  202  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  35.11 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  37.16 
 
 
381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  33.13 
 
 
395 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  34.09 
 
 
325 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  30.94 
 
 
326 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  29.92 
 
 
421 aa  169  8e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  32.19 
 
 
389 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  33.44 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  29.63 
 
 
325 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  36.99 
 
 
453 aa  156  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  29.56 
 
 
326 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  34.46 
 
 
992 aa  85.9  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  39.25 
 
 
271 aa  77  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  35.04 
 
 
1141 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  37.61 
 
 
1323 aa  67  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  27.75 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  24.47 
 
 
894 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  29.89 
 
 
696 aa  59.7  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  25.98 
 
 
676 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  23.39 
 
 
822 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.861457 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.52 
 
 
761 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  26.55 
 
 
643 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  20.99 
 
 
701 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>