More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0516 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  84.99 
 
 
437 aa  752    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  100 
 
 
438 aa  875    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  96.35 
 
 
438 aa  840    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  97.72 
 
 
438 aa  854    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.46 
 
 
426 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  51.17 
 
 
428 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  49.64 
 
 
413 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  50.35 
 
 
428 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  48.72 
 
 
427 aa  403  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  49.65 
 
 
428 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  47.31 
 
 
429 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  48.38 
 
 
429 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2273  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.83 
 
 
240 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0227  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.76 
 
 
227 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.0096121 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.42 
 
 
210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.42 
 
 
210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  37.98 
 
 
212 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.5 
 
 
210 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.5 
 
 
210 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  37 
 
 
210 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3212  3-hexulose-6-phosphate synthase  37 
 
 
211 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1184  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.49 
 
 
225 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.9 
 
 
229 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  35.89 
 
 
389 aa  123  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3043  hexulose-6-phosphate synthase  35.29 
 
 
215 aa  123  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3049  hexulose-6-phosphate synthase  35.29 
 
 
215 aa  123  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0250  hexulose-6-phosphate synthase  38.54 
 
 
228 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000013709  normal  0.0274377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  36.63 
 
 
207 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 
192 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2929  3-hexulose-6-phosphate synthase  35.96 
 
 
211 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000015488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1654  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.62 
 
 
209 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000168104  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.02 
 
 
225 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 
205 aa  108  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  30.36 
 
 
224 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.36 
 
 
393 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1871  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.6 
 
 
217 aa  106  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.356021 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.98 
 
 
237 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  32.26 
 
 
224 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.62 
 
 
219 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  39.88 
 
 
224 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.27 
 
 
196 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.96 
 
 
209 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.37 
 
 
207 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.44 
 
 
403 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.78 
 
 
207 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 
231 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  35.93 
 
 
223 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.21 
 
 
393 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  34.66 
 
 
212 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.89 
 
 
396 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.18 
 
 
391 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.83 
 
 
222 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.942951  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.69 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.27 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  35.23 
 
 
225 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 
232 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.85 
 
 
198 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.33 
 
 
233 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  32.63 
 
 
228 aa  97.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5671  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
211 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.587401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  34.62 
 
 
215 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 
222 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  38.79 
 
 
222 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 
225 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  40.26 
 
 
222 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.29 
 
 
205 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  36.14 
 
 
235 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  30.09 
 
 
233 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  29.41 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.14 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.92 
 
 
234 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.02 
 
 
212 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  33.14 
 
 
212 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0568  hexulose-6-phosphate synthase  37.86 
 
 
217 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1686  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.57 
 
 
221 aa  92  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0279692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.92 
 
 
615 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  30.39 
 
 
235 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.05 
 
 
207 aa  90.5  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.14 
 
 
231 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.43 
 
 
231 aa  90.1  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  30.89 
 
 
229 aa  90.1  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.4 
 
 
221 aa  90.1  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.7 
 
 
240 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.7 
 
 
187 aa  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.16 
 
 
615 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.65 
 
 
217 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  33.16 
 
 
224 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.93 
 
 
230 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  31.01 
 
 
217 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  30.65 
 
 
237 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  29.5 
 
 
216 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  30.65 
 
 
237 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  30.65 
 
 
237 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.97 
 
 
213 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  29.44 
 
 
227 aa  87.8  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 
219 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.22 
 
 
209 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.85 
 
 
246 aa  87.4  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 
206 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.91 
 
 
450 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>