More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0190 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 
305 aa  620  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.12 
 
 
299 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.68 
 
 
303 aa  315  5e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53.06 
 
 
299 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  54.08 
 
 
301 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  54.08 
 
 
301 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.53 
 
 
299 aa  295  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.79 
 
 
326 aa  272  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.52 
 
 
298 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.19 
 
 
313 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.19 
 
 
313 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.52 
 
 
320 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.9 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.3 
 
 
301 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.31 
 
 
299 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.96 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.62 
 
 
298 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.27 
 
 
303 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.43 
 
 
275 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  34.04 
 
 
306 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  36.49 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.52 
 
 
287 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.57 
 
 
293 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.16 
 
 
287 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.8 
 
 
287 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.98 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.89 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.86 
 
 
283 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.5 
 
 
282 aa  112  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.02 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0525218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.52 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.6 
 
 
276 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.03 
 
 
282 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.77 
 
 
281 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.72 
 
 
331 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.32 
 
 
279 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  27.3 
 
 
281 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.68 
 
 
282 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.88 
 
 
291 aa  99.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.5 
 
 
284 aa  99  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.85 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.16 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.67 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.01 
 
 
361 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.47 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.68 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.95 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.27 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.69 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.25 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.93 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  26.97 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.64 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.36 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1127  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.87 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.44 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1347  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.08 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0988459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.2 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.26 
 
 
309 aa  89  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.83 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.71 
 
 
318 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.3 
 
 
337 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.91 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.36 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.25 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.92 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.56 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.56 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  25.17 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.56 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.25 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4123  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.21 
 
 
310 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0241029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.21 
 
 
316 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.74 
 
 
314 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.91 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01965  phosphoribosyl diphosphate synthase isoform 4 (AFU_orthologue; AFUA_4G10790)  23.21 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.25 
 
 
314 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.3 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.28 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.44 
 
 
314 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.08 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.17 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.73 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  23.53 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.28 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.81 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.5 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.61 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.43 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.27 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.88 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.89 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  24.33 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.92 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.75 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.97 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.07 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>