More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10110 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  100 
 
 
101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  72.28 
 
 
102 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  70.3 
 
 
102 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  65.35 
 
 
102 aa  130  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  60.4 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  64.71 
 
 
102 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  59 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  66.34 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  55.45 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  62.38 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  64.36 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  57 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  54 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  61.39 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 
103 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 
103 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 
103 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  53 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  55 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 
102 aa  104  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 
110 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  53 
 
 
104 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  51.92 
 
 
136 aa  103  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  53 
 
 
105 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  52 
 
 
100 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  52 
 
 
103 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
103 aa  102  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
102 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  51.52 
 
 
107 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  51.52 
 
 
107 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  50.51 
 
 
103 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
104 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
104 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
104 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  48.48 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.08 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  86.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  45.63 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  43.56 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  47.06 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  40.4 
 
 
114 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>