More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2355 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  100 
 
 
603 aa  1201    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  56.93 
 
 
611 aa  676    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  57.38 
 
 
600 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  48.09 
 
 
600 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  47.47 
 
 
605 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  48.56 
 
 
599 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  45.94 
 
 
628 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  46.38 
 
 
568 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  42.98 
 
 
583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  41.26 
 
 
625 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
599 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  40.44 
 
 
585 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  45.95 
 
 
583 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  39.56 
 
 
596 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  40.56 
 
 
596 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  40.35 
 
 
586 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 
594 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  37.18 
 
 
614 aa  360  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  38 
 
 
600 aa  340  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  41.13 
 
 
585 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  37.11 
 
 
613 aa  329  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  32.98 
 
 
571 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  33.17 
 
 
610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  31.11 
 
 
601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.78 
 
 
601 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  30.1 
 
 
564 aa  292  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  29.95 
 
 
599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  32.92 
 
 
611 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.67 
 
 
564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  32.92 
 
 
611 aa  271  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  43.11 
 
 
626 aa  269  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  28.06 
 
 
586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.84 
 
 
564 aa  263  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 
564 aa  262  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.57 
 
 
586 aa  253  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.22 
 
 
610 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  32.3 
 
 
612 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  28.85 
 
 
576 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  33.21 
 
 
606 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  29.11 
 
 
607 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  32.84 
 
 
603 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.53 
 
 
594 aa  233  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  33.28 
 
 
592 aa  233  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  31.32 
 
 
613 aa  232  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  26.74 
 
 
552 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.58 
 
 
618 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.53 
 
 
590 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.06 
 
 
574 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.61 
 
 
600 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  34.09 
 
 
589 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.89 
 
 
574 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.78 
 
 
594 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  32.59 
 
 
605 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  35.1 
 
 
620 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.93 
 
 
586 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.37 
 
 
587 aa  221  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
613 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.78 
 
 
594 aa  220  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  34.48 
 
 
578 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.96 
 
 
587 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  28.62 
 
 
676 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.23 
 
 
597 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.12 
 
 
582 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  29.7 
 
 
579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  30.72 
 
 
975 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  31.27 
 
 
610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  33.4 
 
 
655 aa  213  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  33.58 
 
 
739 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  34.08 
 
 
636 aa  213  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  37.59 
 
 
566 aa  213  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3812  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.02 
 
 
610 aa  213  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  31.12 
 
 
588 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  33.21 
 
 
741 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  27.9 
 
 
599 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.74 
 
 
600 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  29.63 
 
 
613 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  31.74 
 
 
610 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.89 
 
 
625 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.86 
 
 
579 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  33.12 
 
 
578 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.83 
 
 
600 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  31.76 
 
 
606 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  33.22 
 
 
601 aa  211  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  32.03 
 
 
596 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.93 
 
 
589 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  31.24 
 
 
613 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  35.17 
 
 
753 aa  211  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  32.9 
 
 
705 aa  211  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  32.03 
 
 
596 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.99 
 
 
578 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.68 
 
 
573 aa  211  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.99 
 
 
578 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.97 
 
 
587 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  32.03 
 
 
631 aa  210  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.78 
 
 
976 aa  209  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  31.82 
 
 
617 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.86 
 
 
576 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  28.54 
 
 
612 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.44 
 
 
598 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.95 
 
 
593 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>