72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1748 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  58.46 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  56.93 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  35.03 
 
 		 183 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  39.13 
 
 		 161 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  46.73 
 
 		 199 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  36.02 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  36.22 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  36.89 
 
 		 192 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  35.48 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  31.86 
 
 		 218 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0821  hypothetical protein  35.93 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  32.76 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 641 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 592 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  26.77 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  28.28 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  32.18 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  34.15 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  25.21 
 
 		 593 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  24.45 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  28.98 
 
 		 565 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  27.63 
 
 		 602 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.53 
 
 		 606 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  32.03 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.69 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  25.96 
 
 		 574 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  26.43 
 
 		 587 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  25.62 
 
 		 596 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  26.15 
 
 		 602 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  31.07 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  32.32 
 
 		 589 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 596 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  30.24 
 
 		 602 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  30.26 
 
 		 589 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  24.59 
 
 		 605 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  22.22 
 
 		 598 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  24.26 
 
 		 576 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  28.76 
 
 		 499 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.11 
 
 		 875 aa  49.3  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.11 
 
 		 869 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.11 
 
 		 871 aa  49.3  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  22.5 
 
 		 617 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  31.06 
 
 		 676 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  29.46 
 
 		 599 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  31.06 
 
 		 668 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23.99 
 
 		 652 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  23.35 
 
 		 616 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  31.06 
 
 		 725 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  31.9 
 
 		 669 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  31.06 
 
 		 668 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  28.79 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  25.83 
 
 		 612 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  23.85 
 
 		 725 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 618 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  32.33 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  22.87 
 
 		 618 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  26.87 
 
 		 1041 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  30 
 
 		 668 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 619 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  22.4 
 
 		 595 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  23.89 
 
 		 1207 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  21.76 
 
 		 599 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 		 693 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  24.11 
 
 		 678 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  30.85 
 
 		 792 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  24.39 
 
 		 731 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>