181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0500 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  68.94 
 
 		 235 aa  340  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  70.21 
 
 		 235 aa  338  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  65.53 
 
 		 234 aa  319  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  67.23 
 
 		 235 aa  317  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  65.96 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  54.04 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  43.81 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  43.36 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  43.42 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  42.92 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  42.11 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  43.29 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  41.15 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  40.87 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  37.66 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  37.89 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  37 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  38.77 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  38.03 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  36.73 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  38.33 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  38.33 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  37.39 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  36.4 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  36.24 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  37.29 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  37 
 
 		 227 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  35.22 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  34.06 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  27.17 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  27.68 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  28.72 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  26.82 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  27.68 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  26.34 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  24.21 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  25.99 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  24.86 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  27.43 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  25.41 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  24.44 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  24.57 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  23.73 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  26.55 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  23.6 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  27.01 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  25.71 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  25.84 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  26.86 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  24.73 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1089  hydrogenase accessory protein HypB  27.46 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  24.16 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  24.31 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  24.57 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  23.03 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  24.85 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  27.32 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  26.29 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  25.71 
 
 		 284 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  24.57 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  28.02 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  25.6 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  25.29 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  24.37 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  25.68 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  21.71 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  25.29 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  25.29 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  25.71 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.7 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  24.73 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  24.29 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  29.61 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  23.89 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  25.71 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  24.16 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  23.24 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  24.14 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  24 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  28.82 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  24.02 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  28 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.67 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  22.35 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  26.67 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  24 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.29 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.67 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  25.6 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  26.7 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.67 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  28.77 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.67 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  26.67 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  28.26 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>