More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4694 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4606  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4694  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.738169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4989  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1569  short chain dehydrogenase  81.16 
 
 		 280 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241614  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5189  short chain dehydrogenase  81.52 
 
 		 280 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673008  normal  0.0207924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13520  short chain dehydrogenase  77.62 
 
 		 314 aa  407  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0292785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.42 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.46 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1515  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303752  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  36.07 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.76 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01588  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.06 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.444586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2011  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.06 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617976  normal  0.65251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01578  hypothetical protein  35.06 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1827  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.06 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2331  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.06 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1694  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.06 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1806  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.06 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1580  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.66 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.06 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  32.34 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.58 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 249 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  35.14 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 248 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  32.81 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.4 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.72 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10945  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  30.98 
 
 		 254 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 265 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>