59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5524 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  44.74 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  48.61 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  48.61 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  45.68 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  41.98 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  41.98 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  43.21 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  43.42 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  34.57 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  40.28 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  36.76 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  34.57 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  33.85 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27820  hypothetical protein  35.06 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  33.8 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0281  hypothetical protein  28.95 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  35.9 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1887  hypothetical protein  48.89 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0795  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  36.73 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 115 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  31.25 
 
 		 91 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>