More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4132 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  100 
 
 
271 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  94.1 
 
 
271 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  92.34 
 
 
274 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  92.34 
 
 
274 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  92.34 
 
 
274 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  83.03 
 
 
271 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  75.91 
 
 
274 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  74.63 
 
 
272 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  69 
 
 
271 aa  367  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  67.77 
 
 
274 aa  345  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  61.25 
 
 
271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  65.68 
 
 
274 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  60.73 
 
 
275 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  65.19 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  61.09 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  61.15 
 
 
278 aa  315  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  59.71 
 
 
278 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  57.55 
 
 
278 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  57.78 
 
 
270 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  58.91 
 
 
276 aa  294  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  56 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  54.32 
 
 
278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.9 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  55.4 
 
 
278 aa  268  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  55.04 
 
 
278 aa  268  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  50.9 
 
 
277 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  52.55 
 
 
275 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  55 
 
 
281 aa  262  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  55.36 
 
 
281 aa  261  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  50.9 
 
 
277 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.35 
 
 
282 aa  255  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  52.16 
 
 
279 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  50.54 
 
 
274 aa  249  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  46.59 
 
 
283 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  49.82 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  43.37 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  44.44 
 
 
276 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.48 
 
 
293 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  40.73 
 
 
273 aa  201  9e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  42.75 
 
 
293 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  45.22 
 
 
291 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  43.12 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  43.12 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  43.12 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  43.12 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  43.12 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  43.12 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  43.12 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  42.39 
 
 
293 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.94 
 
 
292 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  42.75 
 
 
293 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  42.75 
 
 
293 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  42.91 
 
 
292 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  41.67 
 
 
293 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  42.45 
 
 
291 aa  191  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  42.39 
 
 
293 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  42.39 
 
 
293 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  42.39 
 
 
293 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  42.03 
 
 
293 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  41.33 
 
 
291 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  44.12 
 
 
291 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.3 
 
 
288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.91 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  42.75 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.67 
 
 
293 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  42.6 
 
 
285 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  42.6 
 
 
285 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  42.6 
 
 
285 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.88 
 
 
285 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  43.17 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.09 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  43.07 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.52 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  41.09 
 
 
283 aa  181  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  41.52 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  42.39 
 
 
283 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  41.45 
 
 
292 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  41.67 
 
 
294 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  42.18 
 
 
283 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  42.03 
 
 
294 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  40.96 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  42.18 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  42.18 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  42.18 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  42.18 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.93 
 
 
294 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  41.45 
 
 
283 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  40.83 
 
 
307 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  38.71 
 
 
294 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  42.61 
 
 
310 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  40.94 
 
 
283 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  41.45 
 
 
283 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>