More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1463 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  94.67 
 
 		 394 aa  778    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 394 aa  812    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  90.36 
 
 		 394 aa  750    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  90.36 
 
 		 394 aa  750    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  81.22 
 
 		 394 aa  686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  90.36 
 
 		 394 aa  750    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  72.34 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  58.57 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.46 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.45 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.68 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  47.55 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.55 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.46 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.87 
 
 		 393 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.62 
 
 		 393 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.62 
 
 		 393 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.86 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.63 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.42 
 
 		 399 aa  279  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.01 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.86 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.86 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  35.77 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.86 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.55 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.59 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.59 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.85 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.77 
 
 		 397 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.07 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  34.31 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.77 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.1 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.23 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.23 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  33.52 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.26 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  32.82 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.86 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  34.43 
 
 		 415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  35.49 
 
 		 409 aa  215  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.51 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.41 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.74 
 
 		 404 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  32.36 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.29 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.98 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.04 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  35.45 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.95 
 
 		 396 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.77 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.77 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.57 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.49 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  29.4 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.97 
 
 		 392 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.79 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  31.42 
 
 		 636 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.17 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  32.48 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.57 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.27 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.66 
 
 		 392 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.27 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.32 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  30.26 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.16 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.91 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  28.57 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  26.63 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.53 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  27.81 
 
 		 427 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  27.11 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.49 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.86 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  28.94 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.86 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.99 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7405  Acyl-CoA dehydrogenase  24.62 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  25.88 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.85 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.53 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.59 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  26.58 
 
 		 468 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.81 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  25.88 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.77 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.61 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  24.31 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.82 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.59 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.53 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.22 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.33 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0333  hypothetical protein  26.42 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.7 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.68 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.69 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>