37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1313 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  100 
 
 		 172 aa  356  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  54.34 
 
 		 405 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  41.18 
 
 		 352 aa  141  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  42.39 
 
 		 336 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  42.31 
 
 		 335 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  41.58 
 
 		 345 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  42.39 
 
 		 335 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  40.23 
 
 		 335 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  42.31 
 
 		 333 aa  131  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  39.67 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  39.67 
 
 		 350 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  39.13 
 
 		 338 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  39.67 
 
 		 343 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  35.98 
 
 		 343 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  40.11 
 
 		 347 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  36.41 
 
 		 336 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  39.46 
 
 		 341 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  38.54 
 
 		 394 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  39.47 
 
 		 371 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  38.92 
 
 		 341 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  37.57 
 
 		 375 aa  121  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  38.42 
 
 		 338 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  38.51 
 
 		 332 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  35.06 
 
 		 336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  38.15 
 
 		 318 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  39.38 
 
 		 314 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  34.76 
 
 		 334 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  39.6 
 
 		 313 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  34.78 
 
 		 345 aa  97.4  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  32.18 
 
 		 326 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  32.76 
 
 		 326 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  32.18 
 
 		 327 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  32.96 
 
 		 337 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  45.68 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  28.25 
 
 		 331 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.46 
 
 		 413 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  35.06 
 
 		 164 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>