More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl094 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl094  oligopeptide ABC transporter permease component  100 
 
 
444 aa  887    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0161  oligopeptide ABC transporter, permease protein, putative  42.99 
 
 
414 aa  353  4e-96  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1408  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.86 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
369 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0290  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  33.06 
 
 
358 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
349 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
349 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
305 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
379 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
362 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
369 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.02836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
369 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
369 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507851  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
345 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000273194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
344 aa  103  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0290  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.55 
 
 
369 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3119  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.38 
 
 
354 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3742  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.2 
 
 
354 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234646  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
325 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
352 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.124868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41140  ABC transporter permease  29.64 
 
 
360 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3487  ABC transporter permease  29.64 
 
 
360 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
362 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
315 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
360 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
318 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
352 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
384 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 
312 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0266  peptide ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
355 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
352 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
369 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0656  ABC peptide transporter  29.96 
 
 
365 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3694  IM pore protein  30.04 
 
 
312 aa  99.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
332 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
365 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3718  ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
357 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29660  oligopeptide ABC transporter, inner membrane permease component  29.96 
 
 
361 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.124853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177277  normal  0.471787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
357 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0120356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.15 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443887  normal  0.0467925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1496  ABC transporter permease  29.39 
 
 
366 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3074  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.08 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
313 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
357 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
366 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2712  ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
366 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552339  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7053  oligopeptide ABC transporter membrane protein  28.74 
 
 
370 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
344 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0703  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  28.85 
 
 
362 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 
313 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
354 aa  98.2  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
354 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
362 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0883439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0250  peptide ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
318 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
352 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0469446  normal  0.12532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0245  ABC transporter membrane spanning protein (peptide)  29.8 
 
 
363 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169585  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106153  normal  0.226487 
 
 
-
 
NC_004310  BR0008  ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
365 aa  97.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0008  ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
365 aa  97.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00620347  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
350 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.673623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
350 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.82 
 
 
355 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
357 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285143  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7517  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  30.13 
 
 
317 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
344 aa  96.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114687  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.22 
 
 
305 aa  96.7  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2903  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.27 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00817715  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
320 aa  95.9  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.270311  normal  0.8272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
336 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  30.54 
 
 
313 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3030  peptide ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2180  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.8 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5000  ABC transporter, inner membrane subunit  28.11 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
345 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2992  ABC transporter, inner membrane subunit  28.11 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712485  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
336 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.922354  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0421438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0525112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37870  putative peptide ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 
357 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000955556  normal  0.178623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552398  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.39 
 
 
305 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
345 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
305 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
346 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00200208  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
308 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
313 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.7 
 
 
339 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  30.86 
 
 
307 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
361 aa  93.6  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>