More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1949 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 717 aa  1418    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  63.47 
 
 		 775 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  62.34 
 
 		 721 aa  830    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  96.79 
 
 		 717 aa  1319    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  66.06 
 
 		 728 aa  839    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  89.58 
 
 		 710 aa  1239    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  45.68 
 
 		 958 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  47.78 
 
 		 733 aa  538  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 		 625 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 		 765 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 		 625 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  47.9 
 
 		 632 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 		 1509 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  49.82 
 
 		 1275 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 		 1334 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  44.15 
 
 		 731 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.19 
 
 		 1561 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  46.55 
 
 		 625 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  46.47 
 
 		 723 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  40.41 
 
 		 1152 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 		 1152 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 		 1067 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  39 
 
 		 746 aa  432  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 		 734 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  41.62 
 
 		 790 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  39.86 
 
 		 1486 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 880 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  45.29 
 
 		 1084 aa  416  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 		 1991 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 		 658 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  42.68 
 
 		 983 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  39.07 
 
 		 810 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 		 742 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  38.88 
 
 		 742 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  39.41 
 
 		 832 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 742 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  37.64 
 
 		 857 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 		 996 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  37.94 
 
 		 794 aa  362  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  38.8 
 
 		 988 aa  355  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  38.59 
 
 		 1182 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  35.21 
 
 		 783 aa  337  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 		 602 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 		 586 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.72 
 
 		 610 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 617 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  42.23 
 
 		 531 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  41.19 
 
 		 729 aa  301  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 		 684 aa  301  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  44.69 
 
 		 670 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 		 526 aa  293  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  44.72 
 
 		 635 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 2046 aa  288  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  41.74 
 
 		 632 aa  285  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 662 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 		 652 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 958 aa  282  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 555 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 		 653 aa  280  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 551 aa  271  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  39.76 
 
 		 551 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  39.95 
 
 		 539 aa  269  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 		 684 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 		 732 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 796 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.05 
 
 		 809 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 808 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 725 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 1359 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 		 783 aa  256  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  35.3 
 
 		 725 aa  256  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 		 1759 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.21 
 
 		 1644 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.21 
 
 		 1644 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  36.98 
 
 		 1009 aa  252  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 		 576 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 1297 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 1190 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 		 1213 aa  230  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 784 aa  225  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.66 
 
 		 1191 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 1193 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 1198 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 		 556 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 1188 aa  208  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 748 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1694 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 1074 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 974 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  32.77 
 
 		 1003 aa  167  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  31.63 
 
 		 1165 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  31.63 
 
 		 1165 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 1386 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  37.92 
 
 		 1171 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 		 1177 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 		 1162 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 968 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>