More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3222 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 417 aa  808    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  55.44 
 
 		 412 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  48.96 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.72 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.65 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.03 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.91 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.4 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.59 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.59 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.88 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.28 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  30.79 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.79 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.53 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.15 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.7 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.49 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.01 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  35.79 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  29.55 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.98 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.05 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.73 
 
 		 411 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.75 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  31.87 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.42 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  31.18 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.18 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.44 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.54 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.12 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  30.9 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  30.9 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.9 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  29.62 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.02 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  30.9 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.2 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  30.9 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.33 
 
 		 396 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  30.9 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
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NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.51 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  30.9 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.31 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.43 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  28.46 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.44 
 
 		 412 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  30.94 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.8 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.89 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.65 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.35 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.2 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.43 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  31.18 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.03 
 
 		 405 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.48 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.12 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.38 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.5 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.48 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.48 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.55 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  29.3 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.56 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.52 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.92 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.92 
 
 		 405 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.01 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.08 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.81 
 
 		 412 aa  146  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.14 
 
 		 418 aa  146  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 411 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.43 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.63 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  29.07 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.94 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.89 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  30.47 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.87 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.27 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  29.54 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.06 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  32.3 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.7 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.88 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.63 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.95279 
 
 
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