152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2964 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  100 
 
 
340 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  53.09 
 
 
341 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.34 
 
 
417 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.65 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.65 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  27.69 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.78 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.18 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.38 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.16 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  25.58 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  28.69 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.22 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.59 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  22.69 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.27 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  23.05 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  23.35 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4524  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.82 
 
 
374 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  28.89 
 
 
340 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  20.34 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  23.88 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  27.57 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.71 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  25.16 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  29.5 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.32 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  25.26 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  24.25 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.72 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  24.68 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.17 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.95 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.23 
 
 
410 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  22.79 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  22.65 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.89 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  29.92 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4070  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.5 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.951946  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.82 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  22.22 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  22.22 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  24.82 
 
 
339 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  23.81 
 
 
457 aa  52.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  32.91 
 
 
403 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  20.2 
 
 
336 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  25.29 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  25.31 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  29.07 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.79 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  29.07 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  23.65 
 
 
334 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  26.98 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.89 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.86 
 
 
321 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.86 
 
 
321 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  24.89 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  26.64 
 
 
364 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  24.61 
 
 
669 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  26.24 
 
 
312 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.51 
 
 
339 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  24.61 
 
 
669 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.86 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.76 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  31.4 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6358  putative sulfonate ABC transporter, substrate-binding protein  25.1 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  31.19 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  26.54 
 
 
673 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1487  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
334 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.143655  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  21.33 
 
 
464 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.26 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  26.04 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  25.95 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  28.31 
 
 
318 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3922  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.22 
 
 
346 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.59 
 
 
354 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.26 
 
 
334 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>