More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2944 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2944  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 378 aa  763    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245807  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4364  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.58 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3893  ThiJ/PfpI domain protein  44.08 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  41.22 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.03 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3423  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.27 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4743  ThiJ/PfpI  40.8 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2645  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.18 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.62 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.97 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  28.31 
 
 		 492 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  32.3 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  33.55 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  40.34 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.4 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  38.4 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  36 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  38.66 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.98 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  38.94 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  30.46 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.59 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  40.52 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  36.05 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  31.79 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  37.82 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.6 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  34.64 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  37.5 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.38 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  35.33 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.62 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  32.24 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.09 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  32.24 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  40 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  32.65 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  32.24 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>