160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2657 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  100 
 
 
504 aa  1031    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.42 
 
 
456 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  30.87 
 
 
460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  28.66 
 
 
472 aa  170  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.2 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.31 
 
 
490 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  27.27 
 
 
481 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.74 
 
 
468 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  27.31 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.31 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  33.81 
 
 
503 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.52 
 
 
476 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  33.45 
 
 
503 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.03 
 
 
468 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  33.45 
 
 
503 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  30.95 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.5 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30.18 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.63 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.1 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  31.54 
 
 
458 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  29.84 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  30.42 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  28.48 
 
 
457 aa  131  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.7 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  28.66 
 
 
460 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  30.22 
 
 
457 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  29.4 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.28 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 
446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.77 
 
 
450 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  28.23 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  28.69 
 
 
472 aa  126  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.59 
 
 
455 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  28.89 
 
 
463 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  28.89 
 
 
464 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.22 
 
 
486 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  27.88 
 
 
462 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 
481 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.41 
 
 
458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.26 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  27.98 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  29.59 
 
 
476 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  32.09 
 
 
459 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  24.68 
 
 
469 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  27.27 
 
 
450 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.04 
 
 
463 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  28.17 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  26.28 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  25.94 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  26.28 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  28.28 
 
 
462 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.42 
 
 
494 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  28.8 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  25.85 
 
 
483 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.57 
 
 
491 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  24.14 
 
 
482 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  31.61 
 
 
468 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  27.45 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  25.31 
 
 
481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  25.94 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.85 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.92 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  27.19 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27.59 
 
 
485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 
458 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  25.81 
 
 
453 aa  110  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  28.11 
 
 
454 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  26.23 
 
 
481 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  25.45 
 
 
455 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  29.04 
 
 
458 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  27.1 
 
 
453 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  29.51 
 
 
447 aa  107  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  25.84 
 
 
492 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  25.84 
 
 
492 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  25.84 
 
 
492 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  25.84 
 
 
492 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 
488 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.65 
 
 
449 aa  104  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  28.48 
 
 
451 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  25.96 
 
 
463 aa  103  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  26.89 
 
 
451 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  29.11 
 
 
442 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  29.32 
 
 
464 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  28.99 
 
 
464 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.44 
 
 
461 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  25.81 
 
 
453 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  24.59 
 
 
489 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  25.81 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  24.2 
 
 
471 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  26.44 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  26.24 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  28.19 
 
 
461 aa  96.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  27.51 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  25.89 
 
 
485 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  25.83 
 
 
500 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  25.82 
 
 
467 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>