73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1894 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  100 
 
 		 666 aa  1343    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1990  Integrase catalytic region  48.23 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1992  hypothetical protein  39.78 
 
 		 226 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.794624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  22.34 
 
 		 561 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  25 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  23.1 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  23.42 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  23.71 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  23.49 
 
 		 558 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  23.47 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  24.68 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  25.99 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  26.33 
 
 		 581 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.9 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  24.91 
 
 		 724 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  27.96 
 
 		 718 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  24.64 
 
 		 738 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  24.64 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  23.05 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  23.05 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  23.05 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 550 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.79 
 
 		 551 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 509 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  27.17 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  26.1 
 
 		 547 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  29.24 
 
 		 560 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  27.17 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  23.06 
 
 		 417 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  29.24 
 
 		 382 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  23.06 
 
 		 417 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  24.77 
 
 		 715 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  24.77 
 
 		 715 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  24.07 
 
 		 710 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.56 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  26.56 
 
 		 652 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  23.32 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  26.56 
 
 		 652 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  26.56 
 
 		 652 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  25.96 
 
 		 677 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  26.7 
 
 		 416 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 556 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 556 aa  52.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 556 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 556 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  28.03 
 
 		 709 aa  52  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6635  putative integrase protein  24.79 
 
 		 373 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000253479  hitchhiker  0.0000000190144 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  26.9 
 
 		 372 aa  50.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.7 
 
 		 625 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  27.49 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  25.15 
 
 		 690 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0013  integrase, catalytic region  23.78 
 
 		 554 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  28.57 
 
 		 595 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 462 aa  47.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  26.14 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  28.16 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 		 810 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  25.13 
 
 		 523 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.63 
 
 		 552 aa  45.8  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1859  hypothetical protein  23.97 
 
 		 435 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  23.99 
 
 		 782 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  23.87 
 
 		 715 aa  43.9  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>