77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1859 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1859  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  900    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  30.66 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  30.66 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  30.66 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  30.66 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  24.2 
 
 		 617 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  25.94 
 
 		 721 aa  73.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  27.81 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  25.09 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.12 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  29.17 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  27.27 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  25.5 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.27 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  23.87 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  22.9 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  22.9 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  22.9 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  22.9 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  24.12 
 
 		 551 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.3 
 
 		 614 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.72 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.7 
 
 		 560 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  29.07 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  23.67 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.65 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.7 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  23.67 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  23.67 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  23.39 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  29.49 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.67 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  25.97 
 
 		 561 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  26.75 
 
 		 697 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  21.62 
 
 		 782 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  24.92 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.55 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.55 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.73 
 
 		 636 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  23.34 
 
 		 677 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  21.21 
 
 		 636 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  22.38 
 
 		 810 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  25.43 
 
 		 625 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 547 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 		 581 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  26.17 
 
 		 560 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  22.3 
 
 		 650 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  22.71 
 
 		 652 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.08 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  24.6 
 
 		 562 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  22.71 
 
 		 652 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  20.36 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  22.71 
 
 		 652 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  20.36 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  22.71 
 
 		 677 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.6 
 
 		 509 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  21.98 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.36 
 
 		 626 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  24.6 
 
 		 572 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  24.77 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.21 
 
 		 618 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.21 
 
 		 618 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  22.26 
 
 		 733 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  24.27 
 
 		 780 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  22.09 
 
 		 550 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  22.97 
 
 		 649 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.9 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.9 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.9 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  23.4 
 
 		 749 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  23.97 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  24.14 
 
 		 728 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  24.3 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  22.1 
 
 		 560 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  24.59 
 
 		 785 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>