37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1272 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  530  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  44.19 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  31.17 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  29.27 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  33.99 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.26 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  29.82 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  29.3 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  31.06 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  24.52 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  24.77 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  22.55 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  25.14 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  31.54 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  24.06 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  22.18 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  27.74 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  28.03 
 
 		 170 aa  67  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  27.44 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  24.23 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  22.57 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  27.21 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  24.62 
 
 		 176 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 121 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  25.41 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  27.52 
 
 		 385 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 350 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 87 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 135 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  29.23 
 
 		 475 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  34.92 
 
 		 358 aa  42  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>