More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0736 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  62.43 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  63.04 
 
 		 184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  61.75 
 
 		 188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  51.37 
 
 		 182 aa  197  9e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  49.46 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  51.1 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  48.65 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  46.2 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  51.63 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  44.32 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  49.19 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  42.86 
 
 		 188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  39.56 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  40.11 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  37.36 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  38.46 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  35.56 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  35.96 
 
 		 510 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  38.76 
 
 		 509 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  37.64 
 
 		 516 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  32.79 
 
 		 512 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  34.43 
 
 		 508 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  37.3 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  35.96 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.02 
 
 		 526 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  36.22 
 
 		 521 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  37.16 
 
 		 547 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  34.69 
 
 		 527 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  34.69 
 
 		 527 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  33.86 
 
 		 525 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  36.46 
 
 		 533 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.2 
 
 		 530 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  41.88 
 
 		 505 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  35.96 
 
 		 513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.81 
 
 		 533 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  34.92 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  35.29 
 
 		 507 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  34.07 
 
 		 513 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  33.86 
 
 		 525 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  35.56 
 
 		 515 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  33.7 
 
 		 525 aa  114  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  38.8 
 
 		 505 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  37.02 
 
 		 515 aa  114  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  36.46 
 
 		 534 aa  114  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  34.62 
 
 		 529 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  34.43 
 
 		 513 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  34.04 
 
 		 525 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  31.87 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  34.81 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  35.56 
 
 		 527 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  33.86 
 
 		 525 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.15 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  32.78 
 
 		 523 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  34.18 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  34.83 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  34.24 
 
 		 510 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  34.95 
 
 		 520 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  32.8 
 
 		 525 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  32.04 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  33.89 
 
 		 528 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  31.38 
 
 		 542 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  34.62 
 
 		 529 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  36.67 
 
 		 506 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  32.8 
 
 		 525 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  36.96 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  32.8 
 
 		 525 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  32.8 
 
 		 525 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  32.8 
 
 		 525 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  32.95 
 
 		 517 aa  111  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  32.28 
 
 		 525 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  32.28 
 
 		 525 aa  111  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  35.42 
 
 		 527 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  32.28 
 
 		 525 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  32.28 
 
 		 525 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  34.41 
 
 		 520 aa  111  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  32.97 
 
 		 512 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  31.46 
 
 		 514 aa  110  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  32.97 
 
 		 512 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  32.02 
 
 		 511 aa  110  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  31.72 
 
 		 532 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  33.7 
 
 		 523 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  32.97 
 
 		 515 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  32.97 
 
 		 515 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  35.16 
 
 		 523 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  32.97 
 
 		 515 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  37.04 
 
 		 528 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  32.43 
 
 		 512 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  32.04 
 
 		 517 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  33.89 
 
 		 510 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  31.75 
 
 		 525 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  33.88 
 
 		 536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.11 
 
 		 536 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  32.97 
 
 		 512 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  33.33 
 
 		 531 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  32.43 
 
 		 515 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  32.24 
 
 		 509 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  32.43 
 
 		 512 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>