224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0225 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  54.45 
 
 		 189 aa  203  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  51.35 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  46.28 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  46.03 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  44.15 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  41.27 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 		 191 aa  154  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 		 191 aa  150  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  42.02 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.32 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  37.77 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  40.22 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  38.59 
 
 		 211 aa  131  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  38.17 
 
 		 211 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  37.16 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 		 211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  39.67 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  36.41 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  34.39 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  36.32 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.2 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  35.79 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  33.7 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 		 233 aa  98.2  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  32.98 
 
 		 193 aa  90.9  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 		 213 aa  84.3  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  32.6 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3676  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  31.45 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  31.02 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0925  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  33.54 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.46 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  32.5 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  28.09 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  37.65 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>