More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2157 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1822  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
545 aa  1056    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  91.19 
 
 
544 aa  923    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2157  histidine kinase  100 
 
 
545 aa  1056    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.6 
 
 
548 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.27335  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  60.71 
 
 
526 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.74 
 
 
526 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
537 aa  362  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0448  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
536 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
558 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_003296  RS03102  two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.19 
 
 
551 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5449  histidine kinase  31.59 
 
 
542 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
493 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
396 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
425 aa  123  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  31 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
416 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
392 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  28.18 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.67 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
620 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
416 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
416 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  30.61 
 
 
347 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
613 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
909 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
639 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
639 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  29.77 
 
 
480 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.07 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  32.62 
 
 
328 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.78 
 
 
917 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.53 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
463 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
597 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
639 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.11 
 
 
496 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  32.35 
 
 
1366 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
457 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  28.06 
 
 
560 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  25 
 
 
787 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  28.01 
 
 
925 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  29.62 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  28.2 
 
 
917 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.87 
 
 
1301 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
556 aa  111  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
978 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.17 
 
 
481 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
835 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  24.85 
 
 
787 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
466 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
524 aa  110  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
466 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
466 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  31.1 
 
 
389 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
458 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
392 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  31.74 
 
 
416 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  31.74 
 
 
412 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0991  sensor histidine kinase  30.33 
 
 
549 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000699146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  26.61 
 
 
572 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  28.85 
 
 
582 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
369 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.33 
 
 
455 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
462 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  27.81 
 
 
925 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
474 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
484 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
652 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
503 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
524 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  31.97 
 
 
467 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  26.49 
 
 
998 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
922 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  32.83 
 
 
343 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  31.3 
 
 
416 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  28.4 
 
 
360 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  28.46 
 
 
816 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
513 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
600 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  29.57 
 
 
473 aa  107  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  31.47 
 
 
416 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  29.5 
 
 
472 aa  107  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>