More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1787 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1787  ABC transporter related  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169214  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1646  ABC transporter-related protein  51.35 
 
 
223 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1013  ABC transporter related  46.7 
 
 
227 aa  208  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3186  ABC transporter related  46.15 
 
 
232 aa  180  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0133  hypothetical protein  46.24 
 
 
191 aa  154  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.65 
 
 
276 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  35.21 
 
 
385 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  32.28 
 
 
226 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.05 
 
 
279 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0435  ABC transporter related  33.91 
 
 
453 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1803  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 
269 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.41 
 
 
366 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  33.8 
 
 
319 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  31.61 
 
 
221 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3120  ABC transporter, ATPase subunit  35.5 
 
 
348 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 
373 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  33 
 
 
356 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  33.5 
 
 
360 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  33 
 
 
358 aa  99.8  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.53 
 
 
391 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
269 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.82 
 
 
269 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4075  ABC transporter related protein  34.83 
 
 
370 aa  98.2  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848295  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  31.31 
 
 
628 aa  97.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.11 
 
 
376 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.44 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3314  ABC transporter related  35.5 
 
 
348 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.761425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  30 
 
 
303 aa  96.7  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  30.3 
 
 
363 aa  97.1  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.61 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.51 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  32.5 
 
 
370 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  32.46 
 
 
252 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
280 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3228  ABC transporter-related protein  35 
 
 
348 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  32.06 
 
 
370 aa  95.5  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
358 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.02 
 
 
280 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.02 
 
 
280 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  33.82 
 
 
363 aa  95.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
280 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.85 
 
 
300 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.85 
 
 
300 aa  94.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  33.64 
 
 
350 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.02 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.02 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  32.02 
 
 
355 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  31.25 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  32.72 
 
 
342 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  31.56 
 
 
374 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  31.63 
 
 
371 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  31.75 
 
 
254 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  31.75 
 
 
355 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  29.72 
 
 
357 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
300 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.21 
 
 
367 aa  92.8  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  31.5 
 
 
368 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  29.44 
 
 
356 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.35 
 
 
402 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  32.02 
 
 
355 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.34 
 
 
277 aa  92.4  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0947  ATPase  31.43 
 
 
355 aa  92  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  31.61 
 
 
359 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.79 
 
 
280 aa  92  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.67 
 
 
272 aa  91.7  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  32.65 
 
 
340 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  91.7  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  30.58 
 
 
356 aa  91.7  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  31.53 
 
 
355 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  32.16 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  30.66 
 
 
356 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.67 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  29.69 
 
 
360 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  31.53 
 
 
355 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  35 
 
 
353 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.69 
 
 
277 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  31.22 
 
 
365 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  29.08 
 
 
365 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  29.25 
 
 
357 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  31.53 
 
 
355 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  31.53 
 
 
355 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  31.53 
 
 
355 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  32.99 
 
 
281 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  34.67 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  30.61 
 
 
365 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  30.88 
 
 
356 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  33.01 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  32.02 
 
 
578 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 
356 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  30.62 
 
 
362 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.57 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  32.38 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  30.33 
 
 
355 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  28.7 
 
 
275 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  31.65 
 
 
364 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  35.62 
 
 
384 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  31.48 
 
 
358 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  30.88 
 
 
356 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>