More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2703 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  100 
 
 		 746 aa  1509    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  39.53 
 
 		 731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  37.57 
 
 		 728 aa  482  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  45.67 
 
 		 276 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  52.11 
 
 		 272 aa  221  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  51.64 
 
 		 280 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  52.49 
 
 		 251 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  48.33 
 
 		 270 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  44.03 
 
 		 273 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  44.86 
 
 		 273 aa  204  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  42.86 
 
 		 290 aa  204  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  44.03 
 
 		 273 aa  204  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  44.26 
 
 		 272 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  44.21 
 
 		 275 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.69 
 
 		 284 aa  202  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  47 
 
 		 268 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  45.12 
 
 		 274 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  46.43 
 
 		 274 aa  201  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  45.34 
 
 		 274 aa  200  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  46.43 
 
 		 274 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.58 
 
 		 248 aa  198  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  43.39 
 
 		 280 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  45.58 
 
 		 278 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  48.5 
 
 		 259 aa  197  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  45.78 
 
 		 292 aa  197  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  43.5 
 
 		 275 aa  197  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.92 
 
 		 264 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  43.09 
 
 		 277 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  46.69 
 
 		 272 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  43.67 
 
 		 290 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  43.09 
 
 		 276 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  43.5 
 
 		 292 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  42.68 
 
 		 276 aa  194  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  44.89 
 
 		 292 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  44.08 
 
 		 288 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  43.21 
 
 		 291 aa  193  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  42.39 
 
 		 283 aa  193  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  43.27 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  44.21 
 
 		 276 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  43.9 
 
 		 313 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  42.74 
 
 		 275 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  45.69 
 
 		 289 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  42.86 
 
 		 292 aa  191  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  41.32 
 
 		 275 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  46.78 
 
 		 290 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.17 
 
 		 265 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  47.93 
 
 		 274 aa  190  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  42.98 
 
 		 276 aa  190  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.39 
 
 		 296 aa  190  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  46.26 
 
 		 264 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  47.47 
 
 		 274 aa  189  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  48.13 
 
 		 289 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  46.4 
 
 		 274 aa  188  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  41.22 
 
 		 275 aa  188  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  44.91 
 
 		 292 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  44.16 
 
 		 288 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  43.42 
 
 		 324 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  46.82 
 
 		 254 aa  187  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  41.63 
 
 		 293 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  43.29 
 
 		 289 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  44.5 
 
 		 290 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  40.74 
 
 		 275 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.29 
 
 		 296 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  43.04 
 
 		 291 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  45.37 
 
 		 289 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  47 
 
 		 274 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  44.59 
 
 		 274 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  40.66 
 
 		 275 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  41.08 
 
 		 275 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  45.37 
 
 		 289 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  40.25 
 
 		 275 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  45.83 
 
 		 288 aa  184  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  40.33 
 
 		 275 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  43.1 
 
 		 290 aa  183  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  39.83 
 
 		 275 aa  183  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  41.15 
 
 		 275 aa  183  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  44.8 
 
 		 289 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  44.44 
 
 		 288 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  41.63 
 
 		 289 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  43.93 
 
 		 299 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  40.91 
 
 		 275 aa  181  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.63 
 
 		 287 aa  180  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  42.45 
 
 		 296 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.8 
 
 		 324 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  42.86 
 
 		 299 aa  178  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  45 
 
 		 299 aa  178  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  45.37 
 
 		 298 aa  177  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  42.04 
 
 		 326 aa  177  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  42.04 
 
 		 295 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  42.86 
 
 		 297 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  44.86 
 
 		 299 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  43.89 
 
 		 296 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  43.44 
 
 		 293 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  42.59 
 
 		 289 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  43.52 
 
 		 293 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  43.52 
 
 		 293 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.22 
 
 		 296 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  44.24 
 
 		 295 aa  173  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  43.89 
 
 		 295 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  43.52 
 
 		 293 aa  173  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>