198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2620 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  67.1 
 
 
364 aa  325  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  52.14 
 
 
366 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  45.99 
 
 
370 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  44.78 
 
 
342 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  44.74 
 
 
338 aa  168  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  43.39 
 
 
393 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  43.48 
 
 
337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  42.68 
 
 
415 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  39.42 
 
 
395 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  39.34 
 
 
380 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  39.75 
 
 
394 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  44.05 
 
 
343 aa  148  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
384 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
378 aa  145  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
378 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  39.68 
 
 
377 aa  142  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  36.78 
 
 
375 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  39.09 
 
 
377 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  37.29 
 
 
373 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  40 
 
 
386 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  38.63 
 
 
336 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  37.25 
 
 
376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  39.9 
 
 
412 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  37.71 
 
 
372 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  34.47 
 
 
380 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  34.04 
 
 
380 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  32.51 
 
 
397 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  36.29 
 
 
376 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  34.16 
 
 
373 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  34.07 
 
 
375 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  37.02 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  40.62 
 
 
366 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  42.51 
 
 
370 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  37.18 
 
 
372 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  33.06 
 
 
381 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  43.02 
 
 
377 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  35.2 
 
 
381 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  38.73 
 
 
368 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  32.52 
 
 
403 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  37.72 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  34.02 
 
 
412 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  31.82 
 
 
373 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.07 
 
 
380 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  30.86 
 
 
370 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  31.15 
 
 
413 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  36.75 
 
 
366 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  37.31 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  34.21 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  32.93 
 
 
244 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  34.47 
 
 
301 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  30.4 
 
 
404 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  29.22 
 
 
371 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  33.05 
 
 
258 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  33.47 
 
 
379 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  32.51 
 
 
383 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  30.83 
 
 
396 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  28.81 
 
 
370 aa  105  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.34 
 
 
390 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  33.33 
 
 
383 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  32.64 
 
 
370 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  31.67 
 
 
375 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  33.47 
 
 
417 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  33.47 
 
 
417 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.89 
 
 
394 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  34.3 
 
 
431 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  32.66 
 
 
373 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  34.72 
 
 
390 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  31.44 
 
 
374 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  32.77 
 
 
373 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  34.45 
 
 
416 aa  98.6  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  36.11 
 
 
293 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  34.97 
 
 
365 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  35.33 
 
 
405 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  31.33 
 
 
286 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  35.26 
 
 
388 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  31.8 
 
 
393 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  35.53 
 
 
292 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  36.36 
 
 
424 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  31.91 
 
 
374 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  33.88 
 
 
385 aa  92  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  31.91 
 
 
374 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  31.82 
 
 
382 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.38 
 
 
396 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  34.27 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  31.19 
 
 
395 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  32.78 
 
 
392 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  33.83 
 
 
362 aa  88.6  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  30.99 
 
 
385 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0549  peptidase M50  32.96 
 
 
293 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00818515  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  32.81 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  30.37 
 
 
361 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  34.29 
 
 
384 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  37.12 
 
 
378 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  32.77 
 
 
376 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  34.55 
 
 
396 aa  81.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  33.33 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  37.65 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  33.33 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  30.52 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>